Hafta |
Konu |
Ön Hazırlık |
1) |
• Müfredat
• Biyomühendislik laboratuvarına giriş
• Laboratuvar güvenlik kurallarını tartışmak
• Temel laboratuvar araçlarını kullanarak tanımlama
• Laboratuvarlarda not almayı tanımlamak
• Bilimsel raporları tanımlamak ve bilimsel raporlar hazırlamak |
|
2) |
• Ölçüm belirsizliğini tanımlama
• Dengeleri ve mikro dengesizlikleri kullanarak ölçümü tanımlama
• Dengelerin ölçüm belirsizliklerinin hesaplanması |
|
3) |
• Mikroskopi kullanarak tanımlama
• Önceden boyalı slaytlarla mikroskop nasıl kullanılacağını tanımlama
• Epitel örneğini ağızdan hazırlamak ve mikroskop incelemesi için thryphan blue ile boyamak |
|
4) |
• Büyüme Ortamlarını ve Tamponları Tanımlayın
• Ortakları ve tamponları tanımlayın
• Konsantrasyon hesaplamaları
• TBE tamponunun hazırlanması
• LB ve LB-Agar'ın hazırlanması |
|
5) |
• Seri Seyreltmeyi Açıklayın
• Bakteriyel Hücre Kültür Yöntemlerini Tanımlayınız
• Gram boyama yöntemlerini tanımlayın
• Farklı bakteri kültür seyreltmelerinin hesaplamaları
• Farklı bakteri hücre kültürü yöntemlerini tanımlama
• Kültür öncesi bakteri hücreleri ile koloni sayımı
• Önceden kültürlenmiş bakteri hücreleri ile Gram boyama
• Gram boyamanın görüntülenmesi |
|
6) |
• Bakteriyel Büyümeyi Tanımlayın
• Bakteriyel Büyüme Üzerindeki Etkileri UV ve Yüksek Sıcaklık olarak tanımlayın
• Bakteri hücrelerini UV ve yüksek sıcaklık ile muamele etmek; bir grubu kontrol olarak tutmak
• Tekrarlayan UV-Spektrofotometre Metodu
• Önceden ayarlanmış 3 grup bakteri hücre kültürü için bakteri üreme eğrisini çizmek |
|
7) |
Vize haftası |
|
8) |
• Bakteri Hücrelerinden DNA İzolasyonunu Tanımlayın
• DNA İzolasyonunu Kanından Anlatın
• Bakteri hücre kültüründen DNA izolasyonunun temel basamaklarını tanımlamak
• Kan DNA izolasyonunun temel basamaklarını tanımlamak |
|
9) |
• Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) tekniğini tanımlama
• PCR amplifikasyonunda her PCR bileşeni fonksiyonunun tanımlanması
• PCR miksinin nasıl hazırlanacağını açıklamak
• Astar seyreltme
• PCR amplifikasyonunda spesifik primer seçiminin öneminin tartışılması
• PCR sıcaklığının ayarlanması |
|
10) |
• Agaroz jel elektroforezi tekniğini tanımlayın
• Agaroz jel elektroforezi için PCR ürünlerinin hazırlıkları
• Agaroz jel preparatları
• Boya ve DNA işaretleyicisinin yüklenmesindeki rolünü açıklayın
• Agaroz jel elektroforezinde PCR ürünlerinin yüklenmesi ve çalıştırılması
• Agaroz jel elektroforezinin UV ışığındaki sonuçlarının değerlendirilmesi.
• Agaroz jel elektroforez sonuçlarındaki DNA büyüklüğü ve ağırlığının değerlendirilmesi |
|
11) |
• Mikroorganizma kaynaklı plazmid izolasyonunu tanımlayın
• Plazmid yapısını açıklar
• Plazmid izolasyon bileşenleri
• Plazmid arındırma |
|
12) |
• Kısıtlama, sindirim ve ligasyon sürecini açıklayınız
• Restriksiyon enzimlerini tanımlayın
• Sindirim sürecinin tanımlanması
• Ligazların tanımlanması ve bağlanma süreci
• Ligasyon ürünlerinin agaroz jel elektroforezi ile kontrol edilmesi |
|
13) |
• Gerçek zamanlı kantitatif PCR tekniğini (qRT-PCR) tanımlamak
• qRT-PCR-probları ve boyalarında görüntüleme tekniklerini tanımlayın
• QPCR amplifikasyonunda her qPCR bileşen fonksiyonunun tanımlanması
• qPCR karışımının nasıl hazırlanacağını açıklamak
• Standart bir eğrisin çizilmesi ve sonuçların normalleştirilmesi
• qPCR sonuçlarının yorumlanması |
|
14) |
• Protein poliakrilamid jel elektroforezini tanımlayın
• Protein denatürasyonu
• Poliakrilamid jelinin hazırlanması
• Proteinin elektroforezde yüklenmesi ve çalıştırılması
• Jelin görüntülenmesi ile proteinin ağırlığının değerlendirilmesi |
|
15) |
Final Haftası |
|
|
Dersin Program Kazanımlarına Etkisi |
Katkı Payı |
1) |
Matematik, fen bilimleri ve kendi dalları ile ilgili mühendislik konularında yeterli bilgi birikimi; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri mühendislik problemlerini modelleme ve çözme için uygulayabilme becerisi. |
1 |
2) |
Karmaşık mühendislik problemlerini saptama, tanımlama, formüle etme ve çözme becerisi; bu amaçla uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçme ve uygulama becerisi. |
1 |
3) |
Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlama becerisi; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygulama becerisi. (Gerçekçi kısıtlar ve koşullar tasarımın niteliğine göre, ekonomi, çevre sorunları, sürdürülebilirlik, üretilebilirlik, etik, sağlık, güvenlik, sosyal ve politik sorunlar gibi ögeleri içerirler.) |
1 |
4) |
Mühendislik uygulamaları için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirme, seçme ve kullanma becerisi; bilişim teknolojilerini etkin bir şekilde kullanma becerisi. |
1 |
5) |
Karmaşık mühendislik problemlerinin veya disipline özgü araştırma konularının incelenmesi için deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi. |
1 |
6) |
Disiplin içi ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışabilme becerisi; bireysel çalışma becerisi. |
1 |
7) |
Türkçe sözlü ve yazılı etkin iletişim kurma becerisi; en az bir yabancı dil bilgisi; etkin rapor yazma ve yazılı raporları anlama, tasarım ve üretim raporları hazırlayabilme, etkin sunum yapabilme, açık ve anlaşılır talimat verme ve alma becerisi. |
1 |
8) |
Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci; bilgiye erişebilme, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izleme ve kendini sürekli yenileme becerisi. |
|
9) |
Etik ilkelerine uygun davranma, mesleki ve etik sorumluluk bilinci; mühendislik uygulamalarında kullanılan standartlar hakkında bilgi. |
1 |
10) |
Proje yönetimi, risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi, iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi; girişimcilik, yenilikçilik hakkında farkındalık; sürdürülebilir kalkınma hakkında bilgi. |
|
11) |
Mühendislik uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ve çağın mühendislik alanına yansıyan sorunları hakkında bilgi; mühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçları konusunda farkındalık. |
|