ENG349 Introduction to Bioinformatics and Biological Data Analysisİstanbul Okan ÜniversitesiAkademik Programlar Yazılım Mühendisliği (İngilizce) Öğrenciler için Genel BilgiDiploma EkiErasmus BeyanıUlusal Yeterlilikler
Yazılım Mühendisliği (İngilizce)
Lisans TYYÇ: 6. Düzey QF-EHEA: 1. Düzey EQF-LLL: 6. Düzey

Ders Genel Tanıtım Bilgileri

Ders Kodu: ENG349
Ders İsmi: Introduction to Bioinformatics and Biological Data Analysis
Ders Yarıyılı: Güz
Ders Kredileri:
Teorik Pratik Kredi AKTS
3 0 3 5
Öğretim Dili: EN
Ders Koşulu:
Ders İş Deneyimini Gerektiriyor mu?: Hayır
Dersin Türü: Zorunlu Ders
Dersin Seviyesi:
Lisans TYYÇ:6. Düzey QF-EHEA:1. Düzey EQF-LLL:6. Düzey
Dersin Veriliş Şekli: Yüz yüze
Dersin Koordinatörü: Dr.Öğr.Üyesi TUĞBA ÖZDAL
Dersi Veren(ler): Dr.Öğr.Üyesi TUĞBA ÖZDAL
Dersin Yardımcıları:

Dersin Amaç ve İçeriği

Dersin Amacı: Dersin amacı biyoistatistiğin kavramlarını, ilkelerini, yöntemlerini ve uygulamalarını vermektir.
Dersin İçeriği: İstatistiğe giriş. Tablolar ve Grafiklerle Verileri Keşfetme. Verileri Tanımlama, Keşfetme ve Karşılaştırma. Parametrelerin Tahmin Edilmesi ve Örneklem Büyüklüklerinin Belirlenmesi. Hipotez Testi. İki Örneklemden Çıkarımlar. Korelasyon ve Regresyon. Uyum İyiliği ve Olumsallık Tabloları. Varyans Analizi. Korelasyon ve Regresyon. Parametrik olmayan testler. Sağkalım analizi.

Öğrenme Kazanımları

Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
Öğrenme Kazanımları
1 - Bilgi
Kuramsal - Olgusal
1) Biyolojik veri analizinde yöntemlerin doğru ve kullanışlı olmasının gerekçesini anlamak.
2) Biyolojik veri analizinde kullanılan istatistiksel yöntemleri inceleyebilmek.
3) İstatistiksel yöntem ve araçları kullanabilmek.
4) İstatistiksel analiz problemlerini çözebilmek.
2 - Beceriler
Bilişsel - Uygulamalı
3 - Yetkinlikler
İletişim ve Sosyal Yetkinlik
Öğrenme Yetkinliği
Alana Özgü Yetkinlik
Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği

Ders Akış Planı

Hafta Konu Ön Hazırlık
1) Derse giriş. Genel bilgiler ve gereksinimler. Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
2) İstatistiğe Giriş: İstatistiksel ve Eleştirel Düşünme; Veri Türleri; Örnek Verilerin Toplanması Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
3) Tablolar ve Grafikler ile Verileri Keşfetmek: Verilerin Düzenlenmesi ve Özetlenmesi için Frekans Dağılımları Histogramlar Aydınlatan Grafikler ve Aldatan Grafikler Dağılım Grafikleri, Korelasyon ve Regresyon Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
4) Verilerin Tanımlanması, Keşfedilmesi ve Karşılaştırılması: Merkez Ölçüleri Varyasyon Ölçütleri Göreceli Duruş Ölçüleri ve Kutu Grafikler Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
5) Parametrelerin Tahmin Edilmesi ve Örneklem Büyüklüklerinin Belirlenmesi: Bir Nüfus Oranının Tahmin Edilmesi Popülasyon Ortalamasının Tahmin Edilmesi Nüfus Standart Sapmasının Tahmin Edilmesi veya Varyans Bootstrapping: Tahminler için Teknoloji Kullanımı Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
6) Hipotez Testi: Hipotez Testinin Temelleri Bir Oran Hakkındaki İddianın Test Edilmesi Ortalama Hakkında Bir İddianın Test Edilmesi Standart Sapma veya Varyans Hakkında Bir İddianın Test Edilmesi Yeniden Örnekleme: Hipotez Testi için Teknoloji Kullanımı Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
7) İki Örneklemden Çıkarımlar: İki Oran İki Ortalama: Bağımsız Örneklemler Eşleşen Çiftler İki Varyans veya Standart Sapma Yeniden Örnekleme: Çıkarımlar için Teknoloji Kullanımı Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
8) Korelasyon ve Regresyon: Korelasyon Regresyon Tahmin Aralıkları ve Varyasyon Çoklu Regresyon Kukla Değişkenler ve Lojistik Regresyon Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
9) Arasınav Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy Ders notları
10) Uyum İyiliği ve Olumsallık Tabloları: Uygunluk İyiliği Beklenmedik Durum Tabloları Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
11) Varyans Analizi: Tek Yönlü ANOVA İki Yönlü ANOVA Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
12) Parametrik Olmayan Testler: Parametrik Olmayan Testlerin Temelleri İşaret Testi Eşleştirilmiş Çiftler için Wilcoxon İşaretli Sıralar Testi Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
13) Parametrik Olmayan Testler: İki Bağımsız Örneklem için Wilcoxon Sıra Toplamı Testi Üç veya Daha Fazla Örneklem için Kruskal-Wallis Testi Sıra Korelasyonu Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
14) Sağkalım Analizi: Yaşam Tabloları Kaplan-Meier Sağkalım Analizi Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
15) Final sınavı Ders notları Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy

Kaynaklar

Ders Notları / Kitaplar: Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy
Diğer Kaynaklar: Biostatistics for the Biological and Health Sciences. 3rd edition. Year:2024. Author(s): Marc M. Triola, Mario F. Triola, Jason Roy

Ders - Program Öğrenme Kazanım İlişkisi

Ders Öğrenme Kazanımları

1

2

3

4

Program Kazanımları
1) Proje yönetimi ile risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi; girişimcilik, yenilikçilik ve sürdürebilir kalkınma hakkında farkındalık.
2) Matematik, fen bilimleri ve kendi dalları ile ilgili mühendislik konularında yeterli bilgi birikimi; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri mühendislik problemlerini modelleme ve çözme için uygulayabilme becerisi.
3) Karmaşık mühendislik problemlerini saptama, tanımlama, formüle etme ve çözme becerisi; bu amaçla uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçme ve uygulama becerisi.
4) Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlama becerisi; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygulama becerisi. (Gerçekçi kısıtlar ve koşullar tasarımın niteliğine göre, ekonomi, çevre sorunları, sürdürülebilirlik, üretilebilirlik, etik, sağlık, güvenlik, sosyal ve politik sorunlar gibi ögeleri içerirler.)
5) Mühendislik uygulamaları için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirme, seçme ve kullanma becerisi; bilişim teknolojilerini etkin bir şekilde kullanma becerisi.
6) Mühendislik problemlerinin incelenmesi için deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi.
7) Türkçe sözlü ve yazılı etkin iletişim kurma becerisi; en az bir yabancı dil bilgisi.
8) Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci; bilgiye erişebilme, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izleme ve kendini sürekli yenileme becerisi.
9) Mesleki ve etik sorumluluk bilinci.
10) Mühendislik uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ile çağın sorunları hakkında bilgi; mühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçları konusunda farkındalık.
11) Disiplin içi ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışabilme becerisi; bireysel çalışma becerisi.

Ders - Öğrenme Kazanımı İlişkisi

Etkisi Yok 1 En Düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 En Yüksek
           
Dersin Program Kazanımlarına Etkisi Katkı Payı
1) Proje yönetimi ile risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi; girişimcilik, yenilikçilik ve sürdürebilir kalkınma hakkında farkındalık.
2) Matematik, fen bilimleri ve kendi dalları ile ilgili mühendislik konularında yeterli bilgi birikimi; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri mühendislik problemlerini modelleme ve çözme için uygulayabilme becerisi.
3) Karmaşık mühendislik problemlerini saptama, tanımlama, formüle etme ve çözme becerisi; bu amaçla uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçme ve uygulama becerisi.
4) Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlama becerisi; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygulama becerisi. (Gerçekçi kısıtlar ve koşullar tasarımın niteliğine göre, ekonomi, çevre sorunları, sürdürülebilirlik, üretilebilirlik, etik, sağlık, güvenlik, sosyal ve politik sorunlar gibi ögeleri içerirler.)
5) Mühendislik uygulamaları için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirme, seçme ve kullanma becerisi; bilişim teknolojilerini etkin bir şekilde kullanma becerisi.
6) Mühendislik problemlerinin incelenmesi için deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi.
7) Türkçe sözlü ve yazılı etkin iletişim kurma becerisi; en az bir yabancı dil bilgisi.
8) Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci; bilgiye erişebilme, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izleme ve kendini sürekli yenileme becerisi.
9) Mesleki ve etik sorumluluk bilinci.
10) Mühendislik uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ile çağın sorunları hakkında bilgi; mühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçları konusunda farkındalık.
11) Disiplin içi ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışabilme becerisi; bireysel çalışma becerisi.

Öğrenme Etkinliği ve Öğretme Yöntemleri

Anlatım
Bireysel çalışma ve ödevi
Ders
Problem Çözme

Ölçme ve Değerlendirme Yöntemleri ve Kriterleri

Yazılı Sınav (Açık uçlu sorular, çoktan seçmeli, doğru yanlış, eşleştirme, boşluk doldurma, sıralama)

Ölçme ve Değerlendirme

Yarıyıl İçi Çalışmaları Aktivite Sayısı Katkı Payı
Ara Sınavlar 1 % 40
Final 1 % 60
Toplam % 100
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTU KATKISI % 40
YARIYIL SONU ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTUNA KATKISI % 60
Toplam % 100

İş Yükü ve AKTS Kredisi Hesaplaması

Aktiviteler Aktivite Sayısı İş Yükü
Ders Saati 16 48
Sınıf Dışı Ders Çalışması 16 82
Ara Sınavlar 1 3
Final 1 3
Toplam İş Yükü 136